水回りの位置変更、費用が膨らみやすい理由は？

理由：給排水を移設するに際して、壁・床等を開口し、通す必要があり、内装等の修繕作業のコストが追加でかかるためです。

コストを抑えるコツ：
現場判断にはなりますが、露出配管の設えができるようであれば当該施策でコストを一定抑えることは可能です。
ただし、概算での見積には大きな差異が出る可能性や実際には出来ない可能性があるため、必ず現場確認を業者依頼をするようにしてください。